冷冻手术

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TUhjnbcbe - 2021/8/10 19:57:00
白殿 http://pf.39.net/bdfyy/qsnbdf/161204/5066364.html

导读

前段时间,爆红的AlphaFold人工智能系统,因在国际蛋白质结构预测竞赛(CASP)中精确地基于氨基酸序列预测蛋白质的3D结构,且准确性与实验手段获得的结构相差无几,此举再次使结构生物学成为科学研究的热点。

结构生物学研究的三大手段分别是X-ray晶体衍射,NMR核磁共振和冷冻电镜Cryo-EM。无论在科研界还是工业界,一直以来X-ray晶体衍射都占有主导地位,在PDB数据库中,蛋白质的晶体结构占到了绝大多数。

下面中国化信医药团队将与大家分享,到底如何看待这三种结构生物学研究技术?为什么冷冻电镜被认为是最有前景的技术?

X-ray晶体衍射技术

首先,我们来说一说一直占有主导地位的X-ray晶体衍射技术。该技术适合大小在10-kd之间的蛋白质分子,具有分辨率高,尤其局部分辨率较高的特点;蛋白质晶体构建完成后,获得结构的速度很快,且对硬件配置要求不高,很适合高通量蛋白解析。经过几十年的发展,X-ray晶体衍射技术已经十分成熟,目前已解析了大于12万个蛋白质结构。

那么如此成熟的技术,目前在结构生物学研究上到底存在什么局限呢?主要为以下三点:

?前期蛋白质晶体的构建和优化需要很长的准备时间

?蛋白质晶状固体态与蛋白天然原始状态相比,结构存在较大差异

?技术发展至今,目前想找到一个容易结晶且分子大小在10-kd的重要蛋白质分析实属不易

NMR核磁共振技术

其次,我们再来说一说NMR核磁共振技术的特点与限制。该技术适合大小在50kd以下的蛋白质分子,可以直接对蛋白质溶液进行结构解析,但对蛋白质样本的表达量和稳定性都要求很高,未来潜力有限。

冷冻电镜Cryo-EM技术

最后,我们重点聊聊冷冻电镜Cryo-EM技术。该技术近年来发展迅速,频频取得重大技术突破,甚至有取代X-ray晶体衍射技术主导地位之势。年诺贝尔化学奖授予了三位杰出的生物物理学家JacquesDubochet、JoachimFrank和RichardHenderson,以表彰他们在Cryo-EM发展过程中的推动性贡献,使Cryo-EM技术夺得学术界的话题女王桂冠。为什么Cryo-EM技术这么引人
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