1、冷冻治疗
冷冻是一种皮肤科常用的治疗方法，它是以液氮或二氧化碳干冰冷冻皮肤病损，使皮肤损害局部水肿、坏死，以达到治疗的目的。它有大量的小血管，增殖迅速。用冷冻的方法可使尖锐湿疣内结冰，形成组织局部的高度水肿，从而破坏疣体。可用喷雾法或直接接触法，适用于平坦较小的疣体。一般每周冷冻1次，连续2～3次。
优点：价格低廉，操作方便。
缺点：不能够去除病*，复发率高，特殊部位不能使用。
2、激光治疗
激光是皮肤性病科常用的治疗尖锐湿疣的方法。它的特点是见效快，在治疗的当时，疣体即可脱落。常用的是二氧化碳激光，烧灼疣体，一般1次即可使疣体脱落。但是，由于激光的光束过于集中的原故，激光治疗只适用于疣体单一、疣体不大的尖锐湿疣，如疣体较大或较多，激光治疗后复发几率很高。
优点：操作方便，收费比冷冻贵，适宜单个孤立的疣体。
缺点：不能够去除HPV病*，只能去除疣体，激光中产生的烟雾中含有HPV病*散落在患处周围容易导致病情严重，如果HPV病*被患者和医务人员吸人到肺中，引起医源性感染。伤口容易感伤，复发率高。特殊部位不能够使用此方法。
3、微波治疗
它的原理是利用微波的高频震动，使疣体内部水分蒸发，坏死脱落。微波治疗的特点是，疣体破坏彻底，不易复发，但创面恢复较慢，容易继发感染。所以微波治疗特别适用于治疗疣体较大的，孤立、散在的，同时要远离包皮系带的尖锐湿疣，以防损伤包皮系带，影响男性的性功能。
优点：操作方便，收费比冷冻贵，适宜单个孤立的疣体。
缺点：伤口容易感伤，复发率高。治疗不能够去除HPV病*，只能去除疣体，治疗中产生的烟雾中含有HPV病*容易被患者和医务人员吸人到肺中，引起医源性感染。特殊部位不能够使用此方法。
4、电灼治疗
电灼是较老的一种治疗方法。过去皮肤科医师常用高频电刀或电烙铁烧灼寻常疣、色素痣及其他皮肤赘生物。它的特点是操作简单，见效快。高频电刀能直接切除和干燥疣体，治疗也较彻底，但是，电烧灼疮面愈合较缓慢。可用于尖锐湿疣的治疗，但是对施术者的技术要求较高，烧灼太过或不足都是有害的。同时要注意无菌操作，预防感染。
优点：操作方便，收费比冷冻贵，适宜单个孤立的疣体。
缺点：不能够去除HPV病*，只能去除疣体。与激光治疗一样，治疗中产生的烟雾中含有HPV病*容易被患者和医务人员吸人到肺中，引起医源性感染。特殊部位不能够使用此方法。
5、手术治疗
尖锐湿疣一般不主张手术切除，因为手术治疗后，尖锐湿疣很容易复发，使治疗失败。但对带蒂的较大的疣体可考虑手术切除。有的患者尖锐湿疣生长过于迅速，或大如菜花，其他治疗十分困难，可考虑手术治疗。为防止复发，术后配合其他治疗。
优点：操作繁琐，收费比冷冻贵，适宜单个孤立的疣体。
缺点：不能够去除HPV病*，只能去除疣体，伤口容易感染HPV病*复发，复发率高。特殊部位不能够使用此方法。
另外，临床上近年来还出现了艾拉光动力等物理治疗方式，对于光动力而言，更像是激光的微创式治疗，治疗费用高昂，仍然具有较高的复发几率。因此，物理治疗用于疣体的去除效果是有的，但要彻底根治还需要通过更为有效的方法进行治疗，避免反复发作、多次治疗等因素，造成治疗费用和痛苦的加倍。根据权威医学著作《尖锐湿疣的诊治》记载，我国已有针对尖锐湿疣的国家发明专利中医组方，专利号：3，治愈率高达99.62%，经过多年临床验证，只要患者本身没有同时感染艾滋病、系统性红斑狼疮、肾病或长期服用激素类药物的，通过该方均可根治不复发。
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